在增值税开票系统填写红字发票申请信息表，提交税局审批，在税局审批通过之后录入通知单号码，开具负数发票。开具的负数发票账务处理是，借：主营业务收入，应交税费—应交增值税（销项税额），贷：应收账款等科目。